Né Imran Pal à Madison, Wisconsin, États-Unis, d'Anil Pal, ingénieur logiciel, et de Nuzhat Khan, psychologue. Le grand-père d'Imran était un Bengali qui a épousé une Britannique. Le père d'Imran est un hindou bengali qui a étudié avec Mansoor Khan à IT Bombay et travaille maintenant comme cadre supérieur chez Yahoo en Californie. La mère d'Imran Khan est une musulmane issue d'une famille cinématographique, fille du réalisateur-producteur Nasir Hussain, sœur du réalisateur-producteur Mansoor Khan et cousine de l'acteur Aamir Khan. Imran Khan est citoyen américain de naissance. Les parents de Khan ont divorcé alors qu'il était encore tout petit, après quoi sa mère a déménagé à Mumbai. Dans une interview, Imran Khan a qualifié son beau-père, Raj Zutshi, de figure paternelle pendant ses années de croissance. Il a été inscrit à la Bombay Scottish School, où il a été soumis à des châtiments corporels tels que la bastonnade. Selon Imran Khan, il a développé un bégaiement, ses notes ont chuté et sa carrière universitaire a connu un «fort déclin» en raison de son incapacité à faire face à son nouvel environnement et à sa situation familiale radicalement changée; il est devenu nerveux et a développé des tics faciaux. Imran Khan a ensuite déménagé à Sunnyvale, en Californie, où il a vécu avec son père et a fréquenté le Fremont High School. Après avoir obtenu son diplôme, il aspirait à devenir réalisateur et se rendit à Los Angeles pour obtenir un diplôme en cinéma à la branche de Los Angeles de la New York Film Academy. Étudiant la réalisation, l'écriture et la cinématographie, Khan s'inspira de l'écrivain Roald Dahl. Après avoir obtenu son diplôme, il s'est aventuré dans les études de marché et la publicité. Il est finalement retourné à Mumbai et s'est formé au Kishore Namit Kapoor Acting Institute. Pendant sa formation à l'institut de théâtre, Imran Khan a commencé à réseauter et a rencontré le scénariste-réalisateur Abbas Tyrewala, qui lui a proposé le rôle principal dans Jaane Tu ... Ya Jaane Na (2008). Après que le producteur Jhamu Sugandh ait connu des difficultés financières, il a proposé le scénario à Aamir Khan, qui a accepté de financer le film. Ensuite, la comédie romantique a reçu des critiques positives et a été un succès commercial, gagnant 830 millions de ₹ (10 millions de dollars) dans le monde.
En plus de jouer dans des films, Imran Khan est un activiste social et a écrit des articles pour le Hindustan Times. Il est un partisan de PETA People for the Ethical Treatment of Animals; et est apparu dans des événements organisés pour le groupe.